Synchrotrons für die Corona-Forschung

Um COVID-19 zu bekämpfen, brauchen wir Impfstoffe und Medikamente. Für ihre Entwicklung muss man das Virus SARS-CoV-2 genau kennen. Doch für diese Untersuchungen reicht die Auflösung eines normalen Lichtmikroskops nicht aus: Das Virus selbst ist kleiner als die Wellenlänge des sichtbaren Lichtes. Kurzwelligere Photonen, zum Beispiel Röntgenstrahlen, werden mit Synchrotrons produziert. Hier zeigt sich der Vorteil der seit Jahrzehnten etablierten Forschungsinfrastruktur in Deutschland und mit deutscher Beteiligung: Synchrotron-Lichtquellen wie PETRA III und FLASH am Deutschen Elektronensynchrotron (DESY) in Hamburg, BESSY II am Helmholtz-Zentrum Berlin (HZB), European XFEL bei Hamburg oder ESRF in Grenoble, Frankreich, sind solche Großforschungsanlagen. Sie gestatten es, das Virus mit atomarer Genauigkeit abzubilden.

„Das Besondere daran ist: Eine große Gemeinde von Nutzerinnen und Nutzern aus Forschungseinrichtungen, Universitäten und sogar Industrie können ihre Proben dort mit modernsten Messmethoden untersuchen. Dass diese Infrastruktur zur Verfügung steht, ist gerade bei der Corona-Forschung ein riesiger Vorteil“, sagt Prof. Dr. Jan-Dierk Grunwaldt (KIT), Vorsitzender des Komitees Forschung mit Synchrotronstrahlung (KFS).

Das Herzstück eines Synchrotrons ist ein Teilchenbeschleuniger. Dieser beschleunigt Elektronen auf nahezu Lichtgeschwindigkeit. Spezielle Magnete lenken die Elektronen von ihrer Flugbahn im Synchrotron ab; beim Bremsen verlieren sie Energie in Form von Licht. Diese Photonen, die einen weiten Bereich von Infrarot bis Röntgen abdecken, werden dann genutzt, um chemische Prozesse, Zellen und Moleküle, aber auch z. B. die Ausbreitung von Aerosolpartikeln oder das Ausmaß der Schädigung des Lungengewebes von COVID-Patienten zu untersuchen.

Gleich nachdem Anfang 2020 das Genom des neuartigen Coronavirus SARS-CoV2 bekannt wurde, starteten die ersten Messungen von Virus-Molekülen an deutschen Synchtrotrons. Dies war möglich durch ein „Fast-Track-Verfahren“: Während die begehrte Synchrotron-Messzeit normalerweise mehrere Monate im Voraus beantragt werden muss, haben die Synchrotrons ein Schnellverfahren für Coronaforschung eingerichtet und den Betrieb für diese Projekte auch während des Lockdowns aufrechterhalten. Dies hat eine Vielzahl unterschiedlicher Projekte ermöglicht, zum Beispiel:

© Pixabay, Sonja Kalee

Naturstoffe gegen das Coronavirus Ein umfassendes Screening einer großen Naturstoff-Bibliothek an DESYs Röntgenquelle PETRA III zeigt, dass drei Naturstoffe aus Lebensmitteln wie grünem Tee, Olivenöl und Rotwein sich als vielversprechende Kandidaten für die Entwicklung von Medikamenten gegen das Coronavirus erwiesen. Die drei Substanzen binden an ein zentrales Enzym des Coronavirus und können damit die Virusvermehrung lahmlegen. Alle drei Verbindungen werden bereits als Wirkstoffe in bestehenden Medikamenten eingesetzt, wie das Team um Christian Betzel (Universität Hamburg) und Alke Meents (DESY) 2022 im Fachblatt „Communications Biology“ berichtet. [mehr]

© A. Thorn/Uni Hamburg

Neues Modell des Coronavirus Zu Beginn der Corona-Pandemie gab es nur wenig gesicherte Daten über das Virus SARS-CoV-2. Darstellungen beruhten auf niedrig aufgelösten Elektronenmikroskopie-Bildern oder Wissen über das eng verwandte Virus SARS-CoV-1. 2022 hat ein Team unter der Leitung der Biophysikerin Dr. Andrea Thorn von der Universität Hamburg ein neues Modell des Virus erstellt, das Ergebnisse der Kryoelektronenmikroskopie, NMR-Spektroskopie und Synchrotronstrahlung verbindet – und stellt es öffentlich zur Verfügung. [mehr]

© H. Tabermann/HZB

Struktur der Hauptprotease des Coronavirus Im Februar 2020 konnte in Berlin die dreidimensionale Struktur der Hauptprotease des Virus durch Röntgenstrukturanalyse entschlüsselt werden – ein wichtiger Angriffspunkt für Medikamente gegen COVID-19. In einem Projekt am BESSY II mit den Universitäten Lübeck und Hamburg werden mögliche Bindestellen und der richtige Aufbau für Arzneimittel untersucht. Eine vielversprechende Substanz wurde bereits gefunden. [mehr]

© C. Schmid/DESY

Röntgenscreening von Medikamenten Nachdem die 3D-Molekülstruktur der Hauptprotease bekannt war, wurden am DESY in einem groß angelegten „Röntgenscreening“ rund 7000 bereits zugelassene oder sich in der klinischen Erprobung befindende Medikamente auf eine mögliche Wirksamkeit auch gegen das SARS-CoV-2 Virus getestet, in einer Kooperation von DESY, den Universitäten Hamburg und Lübeck, dem Bernhard-Nocht-Institut für Tropenmedizin und Fraunhofer IME. An PETRA III konnten 37 Wirkstoffe identifiziert werden, die an die Hauptprotease binden. Zwei dieser Wirkstoffe sind Anfang 2021 bereits in der präklinischen Testphase. [mehr]

© C. Feiler/HZB

Röntgenscreening NECESSITY Ein weiteres groß angelegtes Screening von Substanzen, die bereits für die Behandlung anderer Erkrankungen zugelassen sind oder sich in klinischen Phasen befinden, wird seit Mitte 2021 vom HZB koordiniert. Gemeinsam mit Partnern der Medizinischen Universität Innsbruck, Österreich, und der Universität Olomouc, Tschechische Republik, wollen die Berliner Forscher*innen die Entwicklung von Medikamenten systematisch vorantreiben. In ihrem Projekt NECESSITY werden mehrere virale Zielproteine adressiert und an den MX-Beamlines von BESSY II untersucht. [mehr]

© BioNTech, Cristina Sala

Verbesserung von RNA-Impfstoffen Das Mainzer Unternehmen BioNTech, der Entwickler eines der ersten Corona-Impfstoffe, forscht an PETRA III gemeinsam mit universitären Partnern nach Möglichkeiten, RNA-Impfstoffe zu verbessern. [mehr]

© DESY

Innovative Verabreichungsformen von Corona-Medikamenten Fachleute suchen mit Hilfe von PETRA III nach innovativen Verabreichungsformen von Corona-Medikamenten mit dem Ziel, mögliche Nebenwirkungen zu mildern. [mehr]

© Kapishnikov et al

Räumliche Darstellung von Coronaviren in Zellen Am Röntgenmikroskop von BESSY II ist es einem Team der Freien Universität Berlin und des HZB gelungen, Coronaviren in Zellen räumlich darzustellen. Aktuell untersuchen sie, wie die Virusaufnahme durch klinisch zugelassene Medikamente aus der Gruppe der Antidepressiva blockiert wird. Antidepressiva beeinflussen fingerförmige Ausstülpungen der Zelle, die so genannten Filopodien. Da auch das Virus an diese Filopodien bindet, kann man mit den Antidepressiva erforschen, ob diese Strukturen in der Infektion eine wichtige Rolle spielen.

© European XFEL

Bindungsprozesse am Coronavirus Für die Entwicklung von Medikamenten ist es wichtig, nicht nur Strukturen zu kennen, sondern auch zu verstehen, welche Prozesse ablaufen. Besonders interessant ist die Frage, wie Substanzen an das Coronavirus binden. Einmalige Einblicke in diese schnellen Prozesse haben internationale Forscherkooperationen unter Beteiligung von DESY am European XFEL gewonnen. [mehr]

© P.Tafforeau/ESRF

Ganze Lungen von COVID-19-Patienten Ganze Lungen von COVID-19-Patienten konnte eine Kooperation der Universitäten Hannover, Heidelberg und Mainz unter Leitung des University College London und der ESRF untersuchen. Im November 2021 wurden die Ergebnisse in nature methods publiziert. Ziel des Projektes ist es, den gesamten menschlichen Körper mit extrem hoher Auflösung zu kartieren (Human Organ Project). [mehr]

© Univ. Göttingen, M. Eckermann/T. Salditt

Zoom in Lungen von COVID-19-Patienten An PETRA III haben Forscherinnen und Forscher der Universität Göttingen mit einem ursprünglich für die Untersuchung von Hirngewebe entwickelten Röntgenverfahren geschädigtes Lungengewebe von COVID-19-Patienten mit bislang unerreicht hoher Auflösung durchleuchtet. Das grundlegende Verständnis der Auswirkungen von COVID-19 ist Basis für bessere Therapien. [mehr]

© HZB / MPI für Intelligente Systeme

Aerosole Ein Team des MPI für Chemie in Mainz sowie des MPI für Dynamik und Selbstorganisation in Göttingen untersucht an BESSY II den Ausstoß und die Eigenschaften von Aerosolpartikeln bei verschiedenen Tätigkeiten wie Sprechen, Singen oder Husten mit Hilfe der Mikrospektroskopie, um ihre Rolle in der Übertragung von Krankheitserregern besser zu verstehen. [mehr]

© Mark McGee

Antikörper identifizieren Ein neuer Ansatz zur Identifizierung von Antikörpern, die COVID-19-Varianten neutralisieren, wurde 2021 an der MASSIF-1-Beamline der ESRF bestätigt. Eine Zusammenarbeit von acht verschiedenen Unternehmen, Wohlfahrtsverbänden und akademischen Einrichtungen im Vereinigten Königreich und in Frankreich, die von der UK BioIndustry Association gegründet wurde, hat diesen Erfolg veröffentlicht und hofft, dass daraus Medikamente entwickelt werden können. [mehr]

„Dass diese Projekte machbar waren, ist kein Zufall, sondern das Ergebnis einer konsequenten und langfristigen Forschungsförderung. Dass wir in Deutschland diese Forschungsinfrastruktur hatten, war ein großes Glück für die Bekämpfung der Pandemie. Gute Forschung dauert einfach länger als eine Legislaturperiode.“ sagt Dr. Andrea Thorn (Uni Hamburg), Leiterin der Coronavirus Structural Task Force und Mitglied des Komitees Forschung mit Synchrotronstrahlung (KFS).

Das KFS ist eine gewählte Vertretung der mehr als 4000 Nutzerinnen und Nutzer von Synchrotronstrahlungsquellen in Deutschland und an internationalen Institutionen mit deutscher Beteiligung.

Für weiterführende Informationen zu den verschiedenen Projekten wenden Sie sich bitte an:

Pressestelle des KFS: Dr. Karin Griewatsch, kfs-presse@sni-portal.de

Oder an:

Pressestelle des HZB: Dr. Antonia Rötger; Antonia.roetger@helmholtz-berlin.de; Tel: 0049 30 8062-43733

s. auch: https://www.helmholtz-berlin.de/forschung/unsere-forschung/photonenforschung/corona-forschung_de.html

Pressestelle des DESY: Dr. Thomas Zoufal, thomas.zoufal@desy.de ; Tel.: 49 40 8998-9-1666

s. auch: https://www.desy.de/aktuelles/corona_forschung/index_ger.html

Pressestelle der ESRF: Delphine Chenevier, press@esrf.fr ; Tel.: 33 4 76 88 26 04

s. auch: https://www.esrf.fr/home/news/general/content-news/general/combatting-covid-19-with-crystallography-and-cryo-em.html

Pressestelle des European XFEL: Dr. Bernd Ebeling, bernd.ebeling@xfel.eu ; Tel: 49 40 8998-6921

s. auch: https://www.xfel.eu/organisation/covid19/index_ger.html

Informationen zur Coronaforschung in der Helmholtz-Gemeinschaft: https://www.helmholtz.de/aktuell/coronavirus-sars-cov-2/

Bilder:

An Synchrotrons wie BESSY II am HZB in Berlin wird das Coronavirus erforscht. Bild: HZB/Wikimedia Commons

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ESRF-Wissenschaftler Gianluca Santoni, der an molekularen Strukturen arbeitet, überprüft Geräte an der Beamline ID23-2. Foto: ESRF/C. Argoud

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DESY-Forscherin Wiebke Ewert zeigt auf einer sogenannten Elektronendichtekarte, wo ein Wirkstoffkandidat (grün) an die Hauptprotease des Coronavirus (blau) bindet. Foto: DESY, Christian Schmid

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